Ćwiczenie 9:

Optymalizacja TS. Prototypowa reakcja SN2: Cl^- + CH₃-Cl -> Cl-CH₃ + Cl^-

Przeprowadź optymalizację stanu przejściowego dla prototypowej reakcji SN2 (RHF/STO-3G). W tym celu

1a) wykonaj obliczenia dla izolowanych reagentów: przeprowadź optymalizację CH₃Cl oraz oblicz energię jonu Cl^-

1b) przeprowadź optymalizację kompleksu VdW: Cl^{- .......} CH₃Cl

1c) znajdź przybliżenie stanu przejściowego poprzez obliczenia „ścieżki reakcji” z założoną współrzędną reakcji (jaką?)

2a) wykonaj analizę wibracyjną dla geometrii z 1c odpowiadającej maksymalnej energii / zmianie znaku gradientu

2b) wykonaj optymalizację TS startujac z geometrii i hessianu z 2a; porównaj geometrią i energię startową i uzyskaną

3) przeprowadź weryfikację TS poprzez obliczenia częstości; opcjonalnie: wyznacz IRC

Oblicz energię oraz energie swobodną aktywacji w 298K (w kcal/mol).