Ćwiczenie 5. (KONKURS!).

Peptyd opiatowy – enkefalina metioninowa jest cząsteczką używaną jako jeden ze standardowych testów metod przeszukiwania przestrzeni konformacyjnej.

Wykonaj optymalizację geometrii dla szeregu wybranych konformacji enkefaliny metioninowej metodą półempitryczną PM3, w celu znalezienia geometrii o najnizszej energii.

Cwiczenie ma charakter konkursu. Znalezione geometrie (macierz Z) oraz odpowiadające im energie (Heat of formation z outputu) można nadsyłać do przedostatnich zajęć w semestrze (włącznie).

Wygrywa osoba, która znajdzie minimum o najniższej energii.

UWAGA! Proszę użyć kombinacji słów kluczowych z pliku met-enk.inp